Au départ, les pilotes Nvidia ne fonctionnaient pas sous F9. Et là, pas grand chose à faire à part attendre.
A mon retour de vacances, petite mise à jour, et, surprise, le paquet kmod-nvidia est disponible !
Après avoir modifié le fichier xorg.conf, je tente de lancer desktop-effects, et là, problème :

 compiz (core) - Error: Could not acquire compositing manager selection on screen 0 display ":0.0"
 compiz (core) - Fatal: No manageable screens found on display :0.0

C'était juste que metacity ne laisse plus la main aussi facilement... Il suffit de changer la clé apps/metacity/general/compositing_manager dans gconf-editor à 0 ou de lancer la commande

 gconftool-2  -–type=bool -s /apps/metacity/general/compositing_manager false

Et voilà !